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Während die Festlegung der cranio-caudalen Polarität im Stadium der Neuralplatte erfolgt, wird die dorso-ventrale Polarität erst später bestimmt. Diese wird durch den Chordafortsatz gesteuert, welcher die Grundplatte des Neuralrohrs induziert (oder allgemeiner: das ventrale Gebiet in Gestalt der basalen motorischen Platten). Diese spezialisierte Gegend des Neuralrohrs besteht aus Zellen mit besonderen Eigenschaften. Sie bilden insbesondere jene chemotaktischen Substanzen, welche das Wachstum der Kommissurenfasern zur kontralateralen Seite steuern. Darüber hinaus soll der Chordafortsatz-Grundplatten-Komplex verantwortlich sein für die frühe Differenzierung der Motoneuronen  13 . In der Tat wird Shh (sonic hedgehog), ein vom Chordafortsatz und später von der Neuralplatte sezerniertes Glycoprotein, auf dieser Höhe die Expression von Genen wie PAX 3 und PAX 7 reprimieren, welche für die Ausbildung der dorso-ventralen Polarität verantwortlich sind. Dadurch wird die Differenzierung von Motoneuronen ermöglicht.
Was das dorsale Territorium angeht, so bildet es die künftigen sensiblen Flügelplatten, deren Dorsalisierung auf die Wirkung einer Kaskade von Wachstumsfaktoren der Familie des TGF-b (Dorsalin, Activin, BMP4) sowie von Wnts zurückgeht. Diese Faktoren sind verantwortlich für die Expression dorsalisierender Gene wie PAX 3 und HOX 7 (msx1). Die Ausbreitung sensibler Zellen nach ventral im Anschluss an eine Ablation des Chordafortsatzes weist auf die hemmende Wirkung von Faktoren hin, welche vom Chordafortsatz stammen. (3, 4, 5, 7)
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